Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Rph3alQ768S4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Rph3alQ768S4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Rph3alQ768S4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Rph3alQ768S4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Rph3alQ768S4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Rph3alQ768S4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Rph3alQ768S4 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rph3alQ768S4 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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