Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LcorQ6ZPI3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms