Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms