Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trak1Q6PD31 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms