Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smchd1Q6P5D8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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