Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Nop58Q6DFW4 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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Nop58Q6DFW4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Nop58Q6DFW4 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Nop58Q6DFW4 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Nop58Q6DFW4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Nop58Q6DFW4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop58Q6DFW4 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Nop58Q6DFW4 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop58Q6DFW4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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