Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Pkp4Q68FH0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Pkp4Q68FH0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Pkp4Q68FH0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Pkp4Q68FH0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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