Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrhQ62361 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrhQ62361 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TrhQ62361 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TrhQ62361 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TrhQ62361 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TrhQ62361 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TrhQ62361 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TrhQ62361 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TrhQ62361 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TrhQ62361 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TrhQ62361 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TrhQ62361 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrhQ62361 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrhQ62361 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TrhQ62361 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TrhQ62361 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrhQ62361 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TrhQ62361 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TrhQ62361 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrhQ62361 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms