Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Trim28Q62318 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Trim28Q62318 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Trim28Q62318 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Trim28Q62318 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Trim28Q62318 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Trim28Q62318 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Trim28Q62318 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim28Q62318 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms