Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ecm1Q61508 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ecm1Q61508 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ecm1Q61508 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ecm1Q61508 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ecm1Q61508 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ecm1Q61508 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ecm1Q61508 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ecm1Q61508 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ecm1Q61508 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ecm1Q61508 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ecm1Q61508 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ecm1Q61508 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Ecm1Q61508 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Ecm1Q61508 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ecm1Q61508 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ecm1Q61508 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ecm1Q61508 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm1Q61508 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms