Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms