Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samhd1Q60710 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samhd1Q60710 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms