Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PtprnQ60673 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PtprnQ60673 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PtprnQ60673 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PtprnQ60673 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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PtprnQ60673 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms