Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms