Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shank3Q4ACU6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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