Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm37306-201ENSMUST00000193447 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms