Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms