Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc114Q3UX62 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc114Q3UX62 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc114Q3UX62 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc114Q3UX62 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc114Q3UX62 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Ccdc114Q3UX62 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccdc114Q3UX62 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccdc114Q3UX62 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccdc114Q3UX62 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccdc114Q3UX62 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccdc114Q3UX62 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccdc114Q3UX62 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccdc114Q3UX62 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc114Q3UX62 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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