Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U595 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q3U595 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q3U595 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q3U595 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q3U595 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q3U595 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q3U595 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q3U595 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q3U595 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U595 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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