Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssbp4Q3U4B1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms