Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rnf149Q3U2C5 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf149Q3U2C5 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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