Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rufy4Q3TYX8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rufy4Q3TYX8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rufy4Q3TYX8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rufy4Q3TYX8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rufy4Q3TYX8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rufy4Q3TYX8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rufy4Q3TYX8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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