Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms