Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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