Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Usp39Q3TIX9 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Usp39Q3TIX9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Usp39Q3TIX9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Usp39Q3TIX9 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Usp39Q3TIX9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Usp39Q3TIX9 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Usp39Q3TIX9 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Usp39Q3TIX9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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