Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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