Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Tmem63a-201ENSMUST00000027800 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm45769-201ENSMUST00000204588 1828 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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