Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rpusd2Q149F1 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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