Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc162pQ0VG85 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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