Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms