Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn2bQ0KL01 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms