Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CbfbQ08024 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms