Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
F13bQ07968 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms