Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gdf3Q07104 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms