Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GscQ02591 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GscQ02591 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GscQ02591 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GscQ02591 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GscQ02591 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GscQ02591 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GscQ02591 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GscQ02591 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GscQ02591 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GscQ02591 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GscQ02591 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GscQ02591 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GscQ02591 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GscQ02591 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GscQ02591 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GscQ02591 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GscQ02591 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GscQ02591 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GscQ02591 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GscQ02591 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GscQ02591 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms