Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23aQ01405 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Sec23aQ01405 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Sec23aQ01405 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Sec23aQ01405 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23aQ01405 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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