Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gja5Q01231 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms