Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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