Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Bop1P97452 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Bop1P97452 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms