Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SmsP97355 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SmsP97355 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SmsP97355 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SmsP97355 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SmsP97355 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SmsP97355 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SmsP97355 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SmsP97355 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SmsP97355 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SmsP97355 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SmsP97355 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SmsP97355 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SmsP97355 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SmsP97355 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SmsP97355 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms