Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RhodP97348 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RhodP97348 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RhodP97348 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
RhodP97348 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RhodP97348 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RhodP97348 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RhodP97348 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms