Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Otx2P80206 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Otx2P80206 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Otx2P80206 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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