Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Acta1P68134 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Acta1P68134 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Acta1P68134 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Acta1P68134 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Acta1P68134 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Acta1P68134 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Acta1P68134 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Acta1P68134 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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