Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab1AP62821 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms