Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp46P62069 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms