Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Lmo4P61969 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.84
Lmo4P61969 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Lmo4P61969 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Lmo4P61969 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Lmo4P61969 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Lmo4P61969 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Lmo4P61969 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Lmo4P61969 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Lmo4P61969 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Lmo4P61969 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Lmo4P61969 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Lmo4P61969 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Lmo4P61969 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms