Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Strn4P58404 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Strn4P58404 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Strn4P58404 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms