Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rad23aP54726 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms