Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PctpP53808 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PctpP53808 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PctpP53808 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PctpP53808 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PctpP53808 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PctpP53808 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PctpP53808 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PctpP53808 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PctpP53808 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PctpP53808 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PctpP53808 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PctpP53808 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PctpP53808 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PctpP53808 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PctpP53808 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PctpP53808 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PctpP53808 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PctpP53808 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PctpP53808 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms