Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

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Length 930 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XpcP51612 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XpcP51612 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XpcP51612 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XpcP51612 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XpcP51612 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XpcP51612 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XpcP51612 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XpcP51612 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XpcP51612 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XpcP51612 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XpcP51612 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XpcP51612 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XpcP51612 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XpcP51612 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XpcP51612 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XpcP51612 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XpcP51612 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XpcP51612 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XpcP51612 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XpcP51612 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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XpcP51612 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XpcP51612 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XpcP51612 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XpcP51612 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XpcP51612 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XpcP51612 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XpcP51612 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XpcP51612 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
XpcP51612 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
XpcP51612 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
XpcP51612 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XpcP51612 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XpcP51612 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XpcP51612 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XpcP51612 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XpcP51612 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XpcP51612 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XpcP51612 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XpcP51612 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
XpcP51612 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XpcP51612 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XpcP51612 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
XpcP51612 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
XpcP51612 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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